This site uses cookies. Some of these cookies are essential to the operation of the site, while others help to improve your experience by providing insights into how the site is being used. For more information, please see the ProZ.com privacy policy.
Cookie settings
fitted coefficient matrix (scoring matrix)
Carboniferous Ketch Member
Dec 8, 2014 19:31
9 yrs ago
1 viewer *
English term

genes upregulated in ERBB2 overexpressing luminal breast cancers

English to Russian Science Biology (-tech,-chem,micro-)
Similar to CHN2 and RGS2 (Fig. 5B), it is predicted that a significant number of" genes upregulated in ERBB2 overexpressing luminal breast cancers are indeed PR-driven.
"

Fig. 1C; compare groups of PR-regulated genes upregulated (1a) or downregulated (1b) by ligand-dependent PRs relative to untreated controls, genes "upregulated (2a) or downregulated" (2b) by ligand-independent PRs" relative to PR-null controls, and ligand-dependent genes upregulated primarily in KR relative to WT (3) or WT relative to KR (4) expressing cell lines

Как можно перевести 1.5 fold upregulated genes, исходя из таблицы, в которой представлено:

строка: genes - Up or Down Regulated in KR - Fold Change
В столбце genes: просто названия генов
В столбце Up or Down Regulated in KR (клеточное линия) (просто идет перечесление: Up, Down и т.д. (что меня и интересует)
Fold Change (цифры с десятичными знаками).
Что мне писать, например, в графе: Up

Спасибо заранее большое!
Proposed translations (Russian)
5 гены, экспрессия которых возрастает при протоковом РМЖ с повышенной экспрессией ERBB2
5 См.
Change log

Dec 8, 2014 19:31: changed "Kudoz queue" from "In queue" to "Public"

Discussion

Tatiana Tkacheva Dec 10, 2014:
Экспрессию можно измерять по кол-ву РНК и по кол-ву белка. Здесь меряли по РНК - продукту транскрипции. Можно написать "повышена экспрессия на уровне транскрипции". Можно, что усиливается транскрипция этого гена.
dao2812 (asker) Dec 10, 2014:
Еще одна головоломка, что такое "transcriptionally upregulated": MSX2 is transcriptionally upregulated in response to progestin treatment of T47D or MCF-7 cells stably or inducibly (T47D) expressing SUMO-deficient PR
Tatiana Tkacheva Dec 10, 2014:
Up/downregulated by receptors: Каким бы ни был механизм всего процесса изменения экспрессии в ответ на внешнее воздействие, запускает его рецептор. Можете написать что-нибудь нейтральное, вроде "посредством рецептора". Про elevated, etc.: авторы явно намудрили с этим expression is over-expressed. Предложенный перевод вполне неплох. Но я бы не стала употреблять "сверхэкспрессия". Ни разу ни встречала такое у специалистов. Похоже, кто-то из переводчиков придумал, и пошло...
Olga Theobald Dec 10, 2014:
По второму вопросу. По моему нужно третье слово, overexpression можно перевести как сверхэкспрессия
http://www.multitran.ru/c/m.exe?l1=1&l2=2&s=overexpression
То есть получаем:
Примечательно, что сверхэкспрессия RGS2 (в повышающей регуляции экспрессии которого в основном участвует рецептор KR) наблюдается в базальных/миоэпителиальных клетках, экспрессия RGS2 значительно повышена при большинстве опухолей молочной железы.
dao2812 (asker) Dec 10, 2014:
А здесь все смешалось upregulated, over-expresse и elevated: что тогда такое elevated? Notably, RGS2 expression (primarily upregulated by the KR receptor) is over-expressed in the basal/myoepithelial compartment and substantially elevated in a majority of breast tumors
dao2812 (asker) Dec 10, 2014:
Меня интересует также предлог by: upregulated or downregulated "by" ligand-independent receptors - как может экспрессия повышатся/понижаться под воздействием рецепторов? Происходит много событий,сигнал-рецептор-регуляторные факторы и т.д. ...
Olga Theobald Dec 10, 2014:
В некоторых других случаях термины up(down)regulatION, (а не regulatED) возможно, и могут так переводится, но не здесь. И да, я ошибаюсь, исправляют ), признаю ошибки, учусь.
Tatiana Tkacheva Dec 10, 2014:
Из описания метода следует, что Вы ошибаетесь, утверждая, что "тут исследователь не сравнивает 2 точки". Мне как профессионалу в биомедицине очевидно, что Вы ошибаетесь и в нескольких других случаях, но доказывать Вам это, простите, не имею ни времени, ни желания. Могу лишь поделиться своими знаниями: английские термины upregulation and downregulation на русский переводятся как повышение и снижение экспрессии.
Olga Theobald Dec 10, 2014:
И что следует из описания этого стандартного метода? Этот метод как-то меняет предложение, которое мы переводим? Куда- то исчез термин "upregulated"?А ведь есть еще "downregulated". И термины эти обозначают действие, которому подвергаются гены, не результат. И действие это регулирование, его производят PR. Результат обозначен словом " overexpressed".
Извините, не знала, что Вы генетик.
Tatiana Tkacheva Dec 10, 2014:
Почитайте раздел Gene expression profiling в статье. Вы узнаете, что экспрессию генов определяли по количеству соответствующей РНК, на микрочипе - это стандартный метод. Чип состоит из ячеек, в каждой - зонд на какой-то один ген. Об изменении экспрессии гена судят по разнице сигналов в данной ячейке между двумя чипами - для контрольных и обработанных клеток. Т.е. сравнивают две точки.
Аналогичный метод можно применить во всех прочих случаях: сначала докопаться до сути, а уж потом выдавать категоричные суждения.
И насчет того, что мы здесь все не генетики, Вы ошибаетесь.
Olga Theobald Dec 10, 2014:
Татьяна, вот весь текст. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3446358/
Дело в том, что тут исследователь не сравнивает 2 точки. Тут очень подробно исследуется и описывается та роль, которую рецепторы прогестерона играют в развитии РМЖ, все этапы. А если все упростить и обобщить, а во всех местах, несущих важнейшую смысловую нагрузку и указывающих на причинно-следственную связь, использовать фразы типа "1 наблюдается при 2 , 1 ассоциируется с 2, 1 на фоне 2, то смысла в переводе не остается.
Термин "повышающая регуляция экспрессии" может Вам лично и резать слух. Только не него дается 73000 ссылок, он общеупотребим и занесен во многие словари, не только в Мультитран.
Мы все здесь не генетики. Клетка секретирует белок в результате экспрессии гена, не экспрессирует. НО ген клетка не секретировать, ни экспрессировать не может.

Proposed translations

8 mins
Selected

гены, экспрессия которых возрастает при протоковом РМЖ с повышенной экспрессией ERBB2

Up- and downregulated = гены, экспрессия которых повышается или понижается при данной обработке. Или повышена в данных клетках по сравнению с контрольными. В таблицах Up and Down = повышение и снижение экспрессии.

1.5-fold upregulated - надо думать, экспрессия повышается в 1.5 раза.

--------------------------------------------------
Note added at 9 hrs (2014-12-09 05:20:59 GMT)
--------------------------------------------------

Overexpression - характеристика статичного состояния, а upregulation - характеристика изменения экспрессии в ответ на что-либо. Клетки опухоли overexpress ген этого рецептора все время, свойство у них такое. В то же время, вполне может быть, что этот ген у них upregulated по сравнению с нормальными клетками, т.е. его экспрессия изменилась в ответ на злокачественное перерождение. Так что принципиальной разницы нет, все зависит от контекста.

--------------------------------------------------
Note added at 1 day10 hrs (2014-12-10 06:25:58 GMT)
--------------------------------------------------

Они "подвергаются понижающей регуляции" (простите, фраза ужасная на мой вкус), и поэтому их экспрессия снижается. На практике исследователь сравнивает две точки и видит, что в одной сигнал (= экспрессия) низкий, а в другой высокий. Т.е. изменился уровень экспрессии. Делают вывод, что исследуемый фактор upregulates экспрессию. В англ. для описания таких экспериментов используют термины up/downregulation. В русском принято говорить о повышении/снижении экспрессии.
Note from asker:
Спасибо! В чем тогда разница между overexpressed genes and upregulated genes?
Татьяна, спасибо! в данном случае нельзя сказать "undergo downregulation"- подвергаются понижающей регуляции? Или все-таки снижается экспрессия? Phospho-Ser294 and S294D receptors are hyperactive transcription factors that undergo rapid ligand-dependent (ubiquitin-mediated) downregulation relative to WT PRs (Daniel et al., 2007b).
Peer comment(s):
neutral Olga Theobald : Клетки опухоли не могут "express или overexpress ген". Экспрессия гена - это процесс, в ходе которого наследственная информация от гена преобразуется в функциональный продукт — РНК или белок
18 hrs
Не поняла, что Вас смущает. Если Вы считаете, что белок экспрессировать клетка может, а ген нет, то это неправильно.
Something went wrong...
4 KudoZ points awarded for this answer. Comment: "Спасибо!"
19 hrs

См.

Аналогично с CHN2 и RGS2 (Fig. 5B), можно предположить, что повышающая регуляция экспрессии значительного количества генов при протоковом раке молочной железы с повышенной экспрессией ERBB2, действительно вызывается PR (рецепторами прогестерона).

Попытаюсь объяснить.
ERBB2 – это белок.
Синтез белка (или по другому скажем, экспрессия гена) идет по схеме ДНК-РНК-белок.
Раковые клетки экспрессируют этот белок в большом количестве. То есть мы наблюдаем повышающую регуляцию экспресии генов. И эта повышающая регуляция (то есть регуляция, заставляющая экспрессировать все больше и больше ERBB2) вызвана именно рецепторами прогестерона.
Потому что рецепторы (недостаточно сумоилированные) МОГУТ влиять на экспрессию генов, они ее регулируют. Тут как раз подходим к "Up or Down Regulated"
Регуляция может быть двух типов: повышающая (up) и понижающая (down)
Вам нужно правильно перевести слово «drive». Как варианты: активировать/стимулировать/запускать механизм/ вызывать…..
Может быть такая аналогия вам поможет понять. Всем известно словосочетание «Драйверы экономики». Что это такое? Это факторы, толкающие экономику вверх, стимулирующие ее, вызывающие ее рост.


--------------------------------------------------
Note added at 19 hrs (2014-12-09 15:01:39 GMT)
--------------------------------------------------

Мультитран, последняя строчка
http://www.multitran.ru/c/m.exe?l1=1&l2=2&s=upregulated
Попробуйте набрать в гугле "повышающая регуляция экспресии гена"
будет около 73000 ссылок

--------------------------------------------------
Note added at 1 day1 hr (2014-12-09 20:40:09 GMT)
--------------------------------------------------

Данный анализ выявил, что в клетках, экспрессирующих сумо-дефицитные рецепторы прогестерона, по сравнению с клетками, экспрессирующими рецепторы WT (дикого типа), показатель повышающей регуляции экспресии 92 LI генов увеличился/вырос более чем в 1,5 раза.
Это именно то, что написано. Интерпретируя написанное, можем сказать, что экспрессия этих 92 генов увеличилась в 1,5 раза.
Note from asker:
Спасибо! Это все понятно. Но как, например, перевести This analysis identified 92 LI "genes upregulated >1.5 fold" in cells expressing SUMO-deficient PR versus WT PR expressing cells
Something went wrong...
Close search
Term search
  • All of ProZ.com
  • Term search
  • Jobs
  • Forums
  • Multiple search